Atualmente, o IFRJ abriga os seguintes periódicos científicos:
- Alimentos: Ciência, Tecnologia e Meio Ambiente (ISSN: 2675-2530)
- Brazilian Journal of Agricultural and Environmental Sciences - BJAES
- Ciências & Ideias (ISSN: 2176-1477)
- Perspectivas da Ciência e Tecnologia (ISSN: 1984-5693)
- Saúde.Com-Ciência (ISSN: 2594-5890)
Para criação de novo periódico, consultar a Instrução de Serviço disponível na biblioteca de documentos da PROPPI.