O Campus Niterói integra a Fase III do Plano de Expansão da Rede de Educação Profissional, Científica e Tecnológica, sendo anunciado em 2011. As atividades do campus foram iniciadas no dia 27 de julho de 2016, com a aula inaugural dos cursos de Formação Inicial e Continuada, no Teatro Popular Oscar Niemeyer, em Niterói. Nesse mesmo local foi assinado o Protocolo de Intenção de Cessão de Espaço, concedendo o uso de uma das construções situadas no Caminho Niemeyer para o funcionamento provisório do campus. Em 2017 foram abertas as primeiras turmas do Ensino Médio Técnico, na forma articulada Concomitante/Subsequente. Em 2019, iniciou-se, também, a oferta de cursos profissionais técnicos de Nível Médio, na forma articulada integrada e pós-graduações lato sensu. Neste mesmo ano o campus foi sediado, em definitivo, no bairro do Sapê, em terreno com área aproximada de 25.000 m2, doado pelo executivo municipal. Em 2023 foi implementado o curso de Formação Inicial em Assistente Administrativo Integrado ao Ensino Médio na Modalidade de Educação de Jovens e Adultos (EJA), iniciando a oferta dessa forma de ensino no campus. A escolha desta modalidade foi baseada em uma série de pesquisas realizadas, norteando a definição dos eixos tecnológicos e as futuras escolhas dos cursos a serem ofertados, bem como na histórica demanda dessa modalidade de ensino (PIC - PLANO DE IMPLANTAÇÃO DO CAMPUS). Consoante com a Visão do IFRJ, o Campus Niterói atua no sentido de consolidação como instituição de referência em educação profissional, científica e tecnológica, integrando as ações de ensino, pesquisa e extensão, com ênfase na disseminação da cultura inovadora e em consonância com as demandas da sociedade. No que respeita à educação na perspectiva da inclusão, o Campus Niterói conta com a atuação do Núcleo de Apoio às Pessoas com Necessidades Específicas (NAPNE), do Núcleo de Estudos Afro-Brasileiros e Indígenas (NEABI), e do Núcleo de Gênero e Diversidade Sexual (NUGEDS), promovendo educação plural e respeitando a diversidade.
